De meeste camera's worden als webcam automatisch herkend door je computer, dus er hoeft waarschijnlijk geen extra software te worden geïnstalleerd. De camera of microscoop kan worden gebruikt met standaard webcamsoftware, zoals de ingebouwde camera-app in Windows of de Photo Booth-applicatie op een Mac. Als de camera extra functies heeft, zoals meetinstrumenten of beeldverwerking, kan deze worden geleverd met eigen software die op je computer moet worden geïnstalleerd om toegang te krijgen tot deze functies.
USB microscopen bieden gemak, betaalbaarheid, veelzijdigheid, beeld-/video-opname, LED-verlichting en mogelijk zelfs extra functies. Hier is een lijst met de belangrijkste voordelen van een USB microscoop: